植物DNA条形码技术的发展及应用_刘宇婧

JournalofPlantResourcesandEnvironment

20(1):74-82,93植物资源与环境学报2011,

ReviewArticle

综述No.24

植物DNA条形码技术的发展及应用

1111,2,

刘宇婧,刘越,黄耀江,龙春林①

(1.中央民族大学生命与环境科学学院,北京100081;2.中国科学院昆明植物研究所,云南昆明650204)

摘要:在对DNA条形码技术的发展过程进行归纳分析的基础上,对植物DNA条形码技术的研究进展、工作流程及影响其鉴定准确性的因素及其在植物分类学研究中的应用现状及存在的争议进行了综合分析和阐述,分析方法、

并展望了植物DNA条形码技术的发展趋势及应用前景。通过具体实例说明将植物DNA条形码技术与传统植物学知识相结合可作为民族植物学的研究手段之一。认为:目前常用的植物DNA条形码主要有单一片段和多片段组trnH-psbA、rbcL和ITS等,这2种方式各有优缺点;常用的DNA序列有matK、但均有一定的局限性;针合2种方式,

对不同的使用目的,应选择不同的植物DNA条形码标准;影响植物DNA条形码鉴定准确性的因素包括物种的类系统树构建方法、杂交/基因渗入、物种起源时间的差异、分子进化速率差异等;当前植物DNA条形码研型和数量、

究工作的重点是选择合适的DNA片段并对其进行评价。

关键词:DNA条形码;发展进程;分类学;植物物种鉴定;民族植物学中图分类号:Q789;Q949

文献标志码:A

文章编号:1674-7895(2011)01-0074-09

ProgressandapplicationofDNAbarcodingtechniqueinplantsLIUYu-jing1,LIUYue1,HUANG

2,①lin1,(1.CollegeofLifeandEnvironmentalSciences,MinzuUniversityofYao-jiang1,LONGChun-China,Beijing100081,China;2.KunmingInstituteofBotany,theChineseAcademyofSciences,

Kunming650204,China),J.PlantResour.&Environ.2011,20(1):74-82,93Abstract:BasedonsummarizationandanalysisofdevelopmentprocessofDNAbarcodingtechnique,researchprogressofDNAbarcodingtechniqueinplants,itsworkingprocessandanalysismethod,influencingfactorsonitsidentificationaccuracy,itsapplicationstatusanddisputeexistinginplanttaxonomicstudywerecomprehensivelyanalyzedanddescribed,andfurtherdevelopmenttrendandapplicationprospectofDNAbarcodingtechniqueinplantswereproposed.Bymeansofsomeresearchexamples,itwasindicatedthatcombiningmethodofDNAbarcodingtechniqueinplantsandtraditionalbotanicalknowledgecouldbetakenasoneofstudyingwaysforethnobotany.Andalso,itwassuggestedthatcommonDNAbarcodinginplantsmainlyweretwomodesofsinglefragmentandmultiplefragmentscombining,andbothofthemhadtheirrespectiveadvantagesanddisadvantages.CommonDNAsequencesincludedmatK,trnH-psbA,rbcLandITS,etc,buttheyallhadacertainlimitation.Different

standardsofDNAbarcodinginplantsshouldbeselectedinordertodifferentapplicationaims.Influencingfactorsonitsidentificationaccuracyincludedtypeandnumberofspecies,constructionmethodofphylogenetictree,hybridizationandgeneintrogression,varianceofspeciesorigintimeandvarianceofmolecularevolutionrate.CurrentfocusonDNAbarcodinginplantsishowtoselectsuitableDNAfragmentsandtoevaluatetheirvalues.

Keywords:DNAbarcoding;developmentprogress;taxonomy;plantspeciesidentification;ethnobotany

收稿日期:2010-08-16

“985”基金项目:国家教育部和国家外专局高等学校创新引智工程项目(B08044);中央民族大学工程项目(MUC-985);中国科学院大科学装置

开放研究项目(O92441112F)

作者简介:刘宇婧(1985—),女,满族,山西大同人,硕士研究生,主要从事植物DNA条形码技术和民族植物学研究。①

E-mail:chunlinlong@hotmail.com通信作者

植物DNA条形码技术的发展及应用_刘宇婧相关文档

最新文档

返回顶部