分子标记技术的应用

分子标记技术的应用

目前,分子标记技术在植物学研究中得到了广泛的应用,如构建遗传图谱、基因定位和克隆及新基因的寻找、遗传多样性和物种亲缘关系研究、系统进化发育、种质资源鉴定和保存、分子标记辅助选择育种等方面。

1 构建遗传图谱

遗传图谱是随着各类分子标记的发展而形成的现代育种观念,具有极其主要的意义,可用来定位和标记目的基因,揭示多基因性状的遗传基础,推动标记辅助育种在生产上的应用等。长期以来,各种植物的遗传图谱几乎都是根据诸如形态、生理和生化等常规标记来构建的,建成遗传图谱的植物种类很少,而且图谱分辨率大多很低,图距大,饱和度低,因而应用价值有限。DNA分子标记用于遗传图谱构建是遗传学领域的重大进展之一。1980年,Bostein首次提出用RFLP作为遗传标记构建连锁图的设想。此后,RFLP首先被应用于人类遗传学研究,并于1987年建成了人的第一张RFLP图谱,其饱和度远远超过了经典的图谱。近几十年来,各种分子标记技术如RAPD、SCAR、SSR、AFLP、SNP等都有成功用于农作物或林木遗传图谱构建的实例,多种分子标记技术结合运用能得到密度更高,遗传距离更大的遗传图谱。

2 基因定位

基因定位即将具有某一表型性状的基因定位于分子标记连锁图中,包括对质量性状(如植物花色、叶形、高矮等,主要由单基因编码)和数量性状(如花期、抗逆性等,由连锁基因编码)的基因定位。质量性状基因的定位有近等基因系(Near Isoallele Lines,NILs)和群分法(Bulked Segregation Analysis,BSA)。数量性状基因(Quantitative Trait Locus,QTL)的定位主要有以标记为基础的分析法(MB法)、以性状为基础的分析法(TB法)和区间作图法。同样,RFLP和RAPD、SCAR、SSR、ISSR、AFLP等标记方法在基因定位中也取得了较大的进展。如Martin等在用144个随机引物进行的RAPD标记中找到3个标记同番茄抗茎腐病基因PtO连锁,并经RFLP分析,将这3个标记定位于RFLP连锁图的第5条染色体上。

3 遗传多样性和物种亲缘关系

通过对随机分布于整个基因组的分子标记的多态性进行比较,能够全面评估研究对象的多样性,并揭示其遗传本质。利用遗传多样性的结果可以对物种进行聚类分析,进而了解其系统发育与亲缘关系,确定亲本间的遗传距离,进而划分杂种优势。因此,分子标记技术已成为分子水平的遗传多样性和物种亲缘关系的有效工具。近年来,运

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