化学信息学之科技文献检索

专业：物理化学

姓名：孙凤霞

摘要 化学是一门实验性的科学，积累了大量的文献和数据，这些文献和数据对化学及同化学有关的研究领域有巨大的参考、应用价值。由于计算机网络技术的飞速发展，越来越多的化学工作者利用计算机技术构造、处理化学信息，各种化学信息的处理与查询变得越来越便利。化学文献检索系统已经成为化学工作者进行科学研究的重要工具。Internet 网上有着丰富的化学信息资源, 从Internet 网络上检索化学教学信息方便快捷。文章介绍了从Internet 网络上检索化学教学信息资源的途径。

关键词 化学信息; 化学文献检索； 化学文献数据库；

化学信息学是近年来发展起来的新学科,它的产生与发展是基于化学信息量指数般增长。信息技术的飞速发展极大地推动了信息资源的网络化, 使Internet 正在成为各种信息全新的载体。Internet 上的化学信息资源的迅猛发展, 使得Internet 上各类化学信息资源越来越丰富, 对化学将产生深刻的影响和带来极大的方便。但目前Internet 上的化学信息资源状况而言, 相关资料的搜索和处理需要有一定的方法和技巧, 如何合理、有效地应用网络化学信息资源科研服务,是需要研究和探讨的问题。

1 化学信息学的定义和内容

迄今为止,化学信息学还没有统一的被广泛接受的定义及英文名称。目前最通用的为Chemoinformatics 及Chemical Informatics。也有用Cheminformatics ,Chemi2informatics。也有人把Chemical Information Science 及Molecular Informatics 称为化学信息学。美国印第安那大学( Indiana University) 在国际上最早在化学图书馆科学的基础上开设化学信息课程及培养化学信息学研究生,他们把化学信息学定义为:化学信息学包括从利用传统的图书馆科学方法组织化学信息到利用现代计算机技术产生、存储、检索及可视化化学信息。 Frank Brown 于1998 年把化学信息学定义为:把各种化学信息源数据组合为信息,把信息提升为知识,其主要目的是在药物先导化合物的发现及优化领域快速地更好地作出决定。这个定义太偏重于药物化学,事实上,化学信息学在其他领域如农业化学也有广泛的应用。

Greg Paris 提出了一个更一般性的定义,他认为:化学信息学是一个一般的术语,它包括化学信息的设计、建立、组织、管理、检索、分析、判别、可视化及使用。

化学信息学的内容包括如下:

(1) 化学信息的组织、管理、检索和使用

化学信息可分为与传媒有关的信息(如文献、图书资料、网络信息等) 及与物质有关的信息(各种实验数据,包括化学反应有关数据,谱学数据,X 射线晶体学数据,化学与物理性质数据,毒性及生物活性数据,与环境有关的数据等) 。化学信息的形式包括:文字、符号、数字、形貌、图形及表格等。

这些化学信息最主要的组织、管理形式是形成数据库。最早的化学数据库是