鸟枪法蛋白质组学的研究动态与应用
第
卷第
期 月
阜阳师范学院学报自然科学版鳍
年
洲
尧沈
鸟枪法蛋白质组学的研究动态与应用 庞小刚赵彦修 山东师范大学逆境植物重点实验室济南摘要介绍了鸟枪法蛋白质组的系统组成研究进展以及在医药领域的应用情况鸟枪法蛋白质组学自出现以来 ,,,,
,
已经成为研究复杂蛋白质混合物的有力工具随着色谱和质谱技术的提高样品制备方法的改进以及多向色谱和蛋
白质组信息学的不断发展鸟枪法蛋白质组学也遇到了机遇和挑战
关锐词鸟枪法,蛋白质组学,研究进展,应用 中图分类号文献标识码 ,
文章编号
一
一
一
在用鸟枪法为基因组测序的时候先将基因组
限和不足
打断分段测序然后利用计算机重组在一起 ,
,
,
,
从而确定一个生物的基因组序列鸟枪法在蛋白质 组研究中的应用方式与此相类似首先将蛋白质混
鸟枪法的实验流程 在鸟枪法蛋白质组中首先从某种样品中提取 ,
合物降解成肤段的混合物利用质谱进行分析测序 , ,
,
蛋白质将其酶解成肤段混合物然后直接上样至双 ,,
然后计算机根据设定好的运算法则描绘出肤段在蛋白质上的位置图谱从而确定该混合物中的蛋白质成分鸟枪法蛋白质组是基于多向液相色谱和质谱技术的方法它摆脱了传统的凝胶分离技术的局 ,
相液向色谱中 ,
协
,
经过电喷雾
气化成离 ,
子最后进入串联质谱的数据运用 ,
进行解析所得到 ,
或
〕
等软件配合
数据库进行分析和确定实验流程如图所示
亲和标签
肚段混合竹
上生串联液鱼鱼
‘
—
相色谱
—
串联质谱
数据分析 蛋白质
复合物
图
鸟枪法蛋白质组的实验流程图
样品的制备
近年来为了和后续的蛋白质组分析方法更加兼容 ,,
,
常规的制备方法有超速离心蔗糖密度梯度等 收稿期 一 一
又出现了很多新的处理的方法例如连续亲合层析 ,
资金项目国家作者简介鹿小刚
课题 仆 ,,
男山东师范大学生物学院逆境植物重点实脸室硕士研究生研究方向发育生物学 ,
,
,
赵彦修博导山东师范大学逆沈挂物重点实脸室山东师范大学校长
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