分子生态学研究现状和发展趋势
技术上主要有用于物种鉴定的分子技术、新探针的构建以及用于种群研究的基因序列分析和引物设计以及探讨基因工程产物的环境适应性和投放环境后所引起的物种与环境互作、物种之间互作、种内竞争等方面的生态效应等重要领域。实际上分子生态学不是简单的分子技术在生态学问题中的应用,其研究内容还远不止于此。
2分子生态学的研究现状
2.1 分子生态学研究途径和技术手段
分子生态学的方法分为两大类,即属于DNA层次的研究方法和蛋白质层次的研究方法。蛋白质层次的研究多采用多位点等位酶为指标,DNA层次的主要研究对象是线粒体DNA、叶绿体DNA、核糖体DNA及基因组DNA。
2.1.1 蛋白质技术
等位酶指一定基因位点上不同的等位基因编码的酶。等位酶分析技术是分子生态学研究中重要的技术手段。等位酶分析技术基本步骤是按个体提取具有活性的酶,然后电泳、染色。为正确解释等位酶谱带,通常要了解每一种等位酶变异的遗传基础,这需要至少分析10-20个独立分离的多态性位点,才能达到统计的可信度。等位酶技术操作相对简单,花费少,统计方法标准。等位酶分析对一些普遍理论的提出作出了重要贡献,如自然种群的遗传维持、性别的进化意义、在适应性进化中基因的角色、种群地理结构的起源以及遗传多样性的生态学意义等。采用蛋白质电泳获得多位点等位酶图谱是分子生态学研究中最有价值的资料之
一。但对于一些狭域分布的地方种群,往往缺乏多态性的位点,无法进行等位酶分析;另外,由于酶自身容易失活等特性,使得该技术在实际应用中具有一定的局限性。
2.1.2 DNA技术。
随着分子生物学技术的迅速发展,DNA分析技术成为生态学家的必然选择。DNA相对于等位酶而言,有更丰富的变异,至能够提供区分个体的特异性“指纹”(fingerprint),同时试验材料易于获得,从化石到活体材料都可以用,且所需材料微少。
DNA通常分2种类型,即核DNA和细胞器DNA。前者亦称为基因组DNA,多适宜于种群内的研究;后者相对保守,主要用于研究种间系谱关系。细胞器DNA多为母系遗传,为研究母系血亲关系提供了可能途径[5]。DNA分析技术与等位酶技术相比较复杂,其基本过程包括:DNA提取、限制性酶切、PCR扩增、分子杂交、基因文库构建、DNA测序或指纹谱带测定等。归纳起来主要有以下几种DNA技术,即限制性片段长度多态性(RFLPs)、随机扩增多态性DNA标记(RAPDs)、可变数目串联重复(VNTRs)以及简单重复间序列标记(ISSR)和DNA测序(DNA sequences)。其中VNTRs包括多位点小卫星(multi-locus minisatellite
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